بررسی ساختار ژن TLR4 در دو ‌سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی

در این مطالعه، ساختار ژن TLR4 به‌عنوان گیرندۀ اصلی در شناسایی لیپوپلی‏ساکارید باکتری‏های گرم منفی در دو ‌سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی بررسی و بیان آن در برخی از اندام‏های اصلی مطالعه شد. از ۱۲۰ قطعه پرنده خون‏گیری و DNA کل آنها استخراج شد. با طراحی چهار جفت آغازگر اختصاصی، کل ژن TLR4 در چهار قطعه از پرندگان هر سویه توالی‏یابی شد. تأثیرات تغییرات اسیدآمینه‏ای بر عملکرد پروتئین با نرم‏افزار PANTHER بررسی شد. بررسی بیان ژن با روش RT-PCR نیمه‌کمّی پس از استخراج RNA از بافت‏های کبد، طحال، و ریه انجام گرفت و سپس تصاویر حاصل از الکتروفورز با نرم‏افزارImage ‏J پردازش و داده‏های حاصل از آن با نرم‏افزار آماری MINITAB تجزیه شد. نتایج تحقیق حاضر، سه SNP جدید (T1147C، A1832G، و C2246A) را نشان داد. بررسی‏های عملکرد پروتئینی نشان داد که همۀ این تغییرات تک‏نوکلئوتیدی در پروتئین مزبور اختلال ایجاد می‏کنند. بیان ژن TLR4 در سویۀ آرین مقادیر بالاتری را در مقایسه با سویۀ بومی نشان داد ولی دو سویه تفاوت معنی‏داری با هم نداشتند. باتوجه به اهمیت بالای این ژن در سیستم ایمنی ذاتی و مشخص‌شدن تغییرات نوکلئوتیدی جدید مؤثر بر ساختار پروتئین حاصل، این ژن می‏تواند به‌عنوان کاندیدی مرتبط با مقاومت ژنتیکی در جمعیت پرندگان مدنظر قرار بگیرد.